东莞市知识产权保护中心于2019年3月批复成立，2021年1月正式运行，2021年9月升格为副处级公益一类事业单位，2024年6月获国家知识产权局批复成立海外知识产权纠纷应对指导东莞工作平台，2025年10月获国家知识产权局批复建设国家级知识产权保护中心。

主要职责是负责全市知识产权公共服务体系建设；承担智能终端和新材料产业专利快速预审、快速确权、快速维权服务；承担知识产权海外维权和涉外应对机制与体系构建工作；承担重大经济和科技活动知识产权分析评议工作；承担知识产权保护协作、维权援助、纠纷调解和案件的咨询、技术判定等公益性服务工作；开展知识产权宣传培训、交流合作及知识产权问题研究工作；指导促进知识产权服务业发展。